二碳酸二叔丁酯可以作为一个保护基，例如在固相肽合成中。受Boc保护的胺对大多数碱和亲核剂没有反应，因此可以使用芴甲氧羰基（Fmoc）作为正交保护基。

　　使用t-boc酸酐完成了从2-哌啶酮开始的6-乙酰基-1,2,3,4-四氢吡啶的合成，这是一种重要的面包香气化合物。见Maillard反应）。

　　该反应序列的xxx步是在乙腈中使用DMAP作为催化剂，通过酰胺氮与boc酸酐的反应形成氨基甲酸酯。由于二碳酸二叔丁酯在加热后会分解成气态产品，因此也可作为聚合物发泡剂使用。

　　二碳酸二叔丁酯的瓶子在密封的容器中会产生内部压力，这是因为它在有水分的情况下会缓慢地分解成碳酸二叔丁酯，最终分解成叔丁醇和二氧化碳。由于这个原因，它通常被出售和储存在塑料瓶中，而不是玻璃瓶。该试剂的主要危害是其吸入性毒性。大鼠4小时内的致死浓度中值为100毫克/立方米，与光气的致死浓度相当（大鼠50分钟内为49毫克/立方米）。

　　顺象医药作为国内最早研发二碳酸二叔丁酯新工艺的公司，一直以来采用独立工厂、专门生产及研发的生产方式，并经过不断的大量生产和实践积累，使得产品在质量、生产安全性、产品收率等多方面持续提升，尤其是对产品生产工艺、原材料进一步优化，使得该产品的生产全过程对环境的污染几乎零。

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